
呼吸鏈上的蛋白質結構 20年來教科書可能搞錯了
糾錯的底氣來自扎實的原始實驗數(shù)據(jù)
這出“張冠李戴”的戲碼為什么會發(fā)生?13個亞基為什么會拋下單獨的亞基NDUFA4相互“連體”呢?
“我們發(fā)現(xiàn),NDUFA4亞基之所以‘行蹤不定’,是因為以往純化復合物4時會加入一種超強的去垢劑,而這種去垢劑可以把一個穩(wěn)定結合在復合物4蛋白中的心磷脂拽下來。”楊茂君解釋,而這個心磷脂恰恰又對NDUFA4的結合至關重要。
更巧合的是,這個“愛逃跑”的亞基結合的界面又是一個關鍵界面,它存在的時候,阻止了13個亞基的復合物“連體”,它被拽下后,讓出了位置,使得二聚體出現(xiàn)。
至此,人們對于復合物4的“誤解”終于揭開謎底。“正確的蛋白質結構,能夠讓我們更加清晰的了解電子傳遞的路徑。”楊茂君說,在復合物4的反應中心,氧氣生成了水,同時另一部分質子(H+)直接被泵入線粒體膜間隙中留作它用。
事實上,遠在論文發(fā)表前幾年,楊茂君就明確了復合物4的結構。面對論文為什么會晚發(fā)表的問題,楊茂君回答,“我們要通過全面的實驗來驗證它是對的,畢竟這個理論已經(jīng)主導了學界20多年,我們提出全新的觀點必須做到嚴謹。”
楊茂君認為,原始創(chuàng)新的第一步很可能是科學研究中的“反常”。如同福爾摩斯用敏銳的觀察力斷案,科學家要對“反常”中體現(xiàn)的真理有敏銳的觸感。
“遇到與理論相悖的實驗,我們會先從自身找原因,對實驗重復、再重復。如果結果依然,再努力證明所看到的反常現(xiàn)象是對的。”楊茂君說,實驗室的傳統(tǒng)是,即便得到的實驗結果非常符合預期,也要至少重復三次,以保證結果是對的。也正是這些扎實的原始實驗數(shù)據(jù),給了楊茂君團隊對教科書說“不”的底氣。
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